Από το 1981 εγκαταβιώνει η σημερινή αδελφότης, με διακονήματα όπως η χρυσοκεντητική, η αγιογραφία, το ζύμωμα λιβανιού, η παραδοσιακή ζύμη φύλλου, η ξυλουργική, η τυροκομία και με ξεχωριστή αγάπη, η βυζαντινή μουσική.
Η μονή του Μαζαράκη Θηβών ιδρύθηκε τον 16° αιώνα. Από τότε χρονολογείται και ο ναός της, αφιερωμένος στον απόστολο και ευαγγελιστή Ιωάννη το Θεολόγο. Είναι χτισμένος σε βυζαντινό ρυθμό Ο «άγιος Γιάννης», όπως τον λένε οι ντόπιοι, κατά την επανάσταση του 1821 διαλύθηκε.
Οι μοναχοί επανήλθαν μετά την απελευθέρωση, αλλά μόνον ως το 1833, οπότε διώχτηκαν Η μονή το 1969, ανασυστάθηκε και επαναλειτούργησε ως γυναικεία.
Από το 1981 εγκαταβιώνει η σημερινή αδελφότης, με διακονήματα όπως η χρυσοκεντητική, η αγιογραφία, το ζύμωμα λιβανιού, η παραδοσιακή ζύμη φύλλου, η ξυλουργική, η τυροκομία και με ξεχωριστή αγάπη, η βυζαντινή μουσική.
Στο μοναστήρι από το 1986 ως το 1996, έτος κοίμησής του, φιλοξενήθηκε ο μακαριστός Μητροπολίτης Θηβών και Λεβαδείας Νικόδημος Γραικός, γνωστός στην ορθόδοξη Εκκλησία ως ο πνευματικός των «κωφαλάλων» αδελφών μας. Ο τάφος του βρίσκεται σήμερα πίσω από το παρεκκλήσιο των Μυροφόρων. Ο προστάτης της μονής άγιος Ιωάννης θεολόγος εορτάζεται δύο φορές το χρόνο: στις 8 Μαΐου και στις 26 Σεπτεμβρίου.